Агароза срещу полиакриламид

Агарозата и полиакриламидът са и водоразтворими полимери, но между тях могат да се видят много разлики, като се започне от техния произход. И агарозата, и полиакриламидът имат нещо общо в способността си да образуват порести гел-матрици. Въпреки това съществуват редица различни разлики между двете. Основните разлики между двата полимера се състоят в естеството на произход, химическата им структура, различните им приложения и ефективността им по отношение на гел електрофорезата.

Какво е агароза?

Агарозата е естествен линеен полимер, който от своя страна се получава от сложен полимер, наречен агар, открит в морските водорасли. Агарозата се извлича от агар чрез отстраняване на протеиновия му компонент, наречен агаропектин. Агарозата е това, което дава на агар способността му да образува гелове.

Основната употреба на агарозата е в микробиологични и молекулярно биологични изследвания. При микробиологични изследвания агарозата, когато се допълва с подходящи хранителни вещества, осигурява солидна основа за култивиране на микроорганизми като бактерии и гъбички. Когато се използва в полутвърди концентрации, може да бъде полезно при оценката на подвижността на тези микроорганизми. В молекулярната биология той служи като важен инструмент за един от най-фундаменталните процеси на разделителна способност, наречен „гел електрофореза“ или „електрофореза с агарозен гел“ (AGE). Гел електрофорезата е процес, който позволява разделяне или разделяне на нуклеинови киселини или протеин въз основа на техния размер и заряд. Тук агарозата служи като порест гел, подобен на сито, чрез който се случва разделянето.

Какво е полиакриламид?

Полиакриламидът е синтетичен полимер и се използва в най-различни индустрии. Както беше споменато по-горе, използването му разчита на способността му да образува гелове. В допълнение към това, способността му да задържа и оттича вода в различни концентрации се използва и в различни индустрии.

Най-разпространената и разпространена употреба на полиакриламид е при пречистването на отпадъчните води. Тук той се използва като флокулиращ агент за отстраняване на всеки суспендиран органичен материал; следователно, подобряване на мътността и избистряне на водата. Друга употреба на полиакриламид е в хартиената промишленост. Тук се използва за задържане или изтичане на вода от хартиената маса, както се изисква. По подобен начин в селското стопанство и строителството се използва като почвен балсам за предотвратяване на ерозия на почвата и подобряване на нейното качество.

Подобно на агарозата, и полиакриламидът се използва в молекулярната биология като важен инструмент за разделяне в подобен процес, наречен „Полиакриламиден гел електрофореза“ (PAGE). В допълнение към всичко това, полиакриламидът се използва и при преработката на руда и производството на флокулиращ агент за отстраняване на всякакви суспендирани органични материали; следователно, подобряване на мътността и избистряне на водата. Друга употреба на полиакриламид е в хартиената промишленост. Тук се използва за задържане или изтичане на вода от хартиената маса, както се изисква. По подобен начин в селското стопанство и строителството се използва като почвен балсам за предотвратяване на ерозия на почвата и подобряване на нейното качество. В допълнение към всичко това, полиакриламидът се използва и при производството на хранителни добавки, меки контактни лещи и текстил.

Каква е разликата между агароза и полиакриламид?

Произход на агароза и полиакриламид:

Агароза: Агарозата е полимер с естествен произход. Той се добива от морски водорасли.

Полиакриламид: Полиакриламидът е от синтетичен произход и не се намира при никакви естествени обстоятелства.

Молекулярна формула на агароза и полиакриламид:

Агароза: Молекулната формула на агарозата е C24H38O19.

Полиакриламид: Молекулната формула на полиакриламид е (C 3H5NO) n.

Химична структура на агароза и полиакриламид:

Агароза: Агарозата е линеен полизахарид. Той е съставен от повтарящи се дизахаридни единици, наречени агробиоза, държани заедно от водородни връзки.

Полиакриламид: Полиакриламидът е химически омрежен полимер. Съставен е от акриламидни мономери и омрежаващо средство N, N'-метиленбисакриламид.

Токсичност на агароза и полиакриламид:

Агароза: И агарозата, и нейната мономерна единица агробиоза са нетоксични по своята същност.

Полиакриламид: Мономерната единица на полиакриламид, акриламид, е предполагаем канцероген и известен невротоксин, докато полимеризираната му форма е нетоксична по своята същност.

Характеристики на гелове от агароза и полиакриламид:

Възраст и страница:

Агароза: Приготвянето на агарозен гел за AGE е по-малко време, лесно и просто и не изисква инициатор или полимеризиращ катализатор.

Полиакриламид: Полиакриламидният гел препарат за PAGE е отнемащ време и досаден и също изисква инициатор (амониев персулфат) и полимеризиращ катализатор (N, N, N ', N'-тетраметилетилендиамин - TEMED).

Природа:

Полиакриламидните гелове са химически по-стабилни от агарозните гелове.

Размер на порите:

Като се има предвид същата концентрация, матриците на полиакриламидния гел имат тенденция да имат по-малки пори в сравнение с матрицата на агарозния гел.

Промяна на размера на порите:

Размерът на порите на полиакриламидни гелове може да бъде променен по-контролиран начин от този на агарозните гелове.

Разделителна мощност:

Полиакриламидните гелове имат висока разделителна сила, докато агарозните гелове имат ниска разделителна мощност.

Настаняване на нуклеинова киселина:

Полиакриламидните гелове могат да приемат по-големи количества нуклеинова киселина от агарозните гелове за разделителна способност.

Образуване на изображения: Агароза и структура на полиакриламид чрез Wikicommons (Public Domain)