Ключова разлика - Протеомика срещу Транскриптомика
 

Омичната технология е актуална тенденция, при която различните биомолекули на организма се разглеждат като цялостна колекция по отношение на неговите свойства и функции. Технологията omic има широк спектър от приложения. Различните омики на биологична проба включват геномика, протеомика, транскриптомия и метаболомика. Протеомиката включва цялостно изследване на всички протеини в жив организъм. Определя се като съвкупност от всички експресирани протеини в организма, неговите структурни и функционални свойства. Следователно пълният набор от протеини образуват протеома. Транскриптомиката е пълното изследване на всички пратеници на РНК (мРНК) молекули, присъстващи в жив организъм. Така транскриптомиката се занимава с гените, които активно се експресират в жив организъм. Общият набор от мРНК в жив организъм се нарича транскриптом. Ключовата разлика между Proteomics и Transcriptomics се основава на вида на биомолекулата. В протеомиката се изследва общият набор от експресирани протеини в жив организъм, докато в транскриптомиката се изследва общата мРНК на жив организъм.

СЪДЪРЖАНИЕ

1. Преглед и ключова разлика
2. Какво е протеомика
3. Какво е транскриптомика
4. Прилики между протеомиката и транскриптомиката
5. Паралелно сравнение - Протеомика срещу Транскриптомика в таблична форма
6. Резюме

Какво е протеомика?

Терминът протеомика е въведен през 1995 г. и първоначално е дефиниран като общия протеинов добавка в клетка, тъкан или организъм. С напредването на протеомичните проучвания той беше променен, за да се разглежда като чадър термин, в който бяха включени много области на изследване. В момента под темата протеомиката се изучават структурата, ориентацията, функциите, взаимодействията й, модификациите, приложенията и значението на протеините. Затова в момента се провеждат много изследвания в областта на протеомиката.

Първите протеомични проучвания са направени за идентифициране на съдържанието на протеини в Escherichia coli. Картирането на общото съдържание на протеини беше направено с помощта на двумерни (2D) гелове. След успеха на това учените преминаха към характеризиране на общото съдържание на протеини в животни като морски свинчета и мишки. В момента картографирането на протеини при човека се извършва с помощта на 2D гел електрофореза.

Приложения на Proteomics

Има много предимства при изучаването на протеомиката, тъй като протеините са управляващи молекули на по-голямата част от активността поради свойството на катализатора на протеините. По този начин, изследването на цели протеини може да предостави информация относно здравословното състояние на организма. Някои приложения са;

  1. Анотация на генома: Чрез изучаване съдържанието на протеини в организма могат да се определят точните геноми, отговорни за активното протеиново съединение. В този сценарий са важни резултатите от всички геномики, Transcriptomics и протеомиката. Идентификация на заболяването / Диагностика: Протеомиката се използва за идентифициране на болестното състояние, като се сравняват здравите и болните За провеждане на експресия на протеин, изследвана по време на експерименти. Модификации на протеини и взаимодействия: За да се използват протеини в условия in vitro или и in vivo условия, да се определят условията на съхранение на тези екстрахирани протеини и да се изследва поведението на протеина in vitro, in vivo и in-silico методи.

Има различни техники, участващи в протеомиката

  1. Екстракция на общия протеин и отделяне на протеините с помощта на 2D гел електрофореза. Протеините също могат да бъдат разделени с помощта на високоефективна течна хроматография (HPLC). Секвениране на екстрахираните протеини с помощта на методи като метод на секвениране на Едмунд или Мас-спектрометрия. След като се идентифицират последователностите, структурни и функционални свойства на протеиновото съдържание се анализират с помощта на компютърен софтуер и инструменти за биоинформатика.

Какво е Transcriptomics?

Терминът за преписване е измислен наскоро. Транскриптомиката е изследване на общото съдържание на мРНК в организма. Общата иРНК е експресираната ДНК в жив организъм или клетка. Пълната колекция от тРНК е посочена като транскрипт.

Стъпките към анализа на транскрипта включват:

  1. Екстракция на РНК, отделяне на тРНК с помощта на колонна гел хроматография с поли DT зърна. Извършва се секвенирането на тРНК.

Microarray технологията е един често срещан начин за идентифициране на стенограмата на организма. Техниката на микромасив включва пробна плоча с допълващите нишки на транскриптама. При хибридизация може да се характеризира тРНК, присъстваща в организма или клетките.

Транскриптомиката сега се използва широко в медицинската област. Диагностиката на заболяванията и профилирането на заболяването са основни области, в които се използва Transcriptomics. Чрез анализ на транскрипт на организъм може да се идентифицира чуждата иРНК и ако има някакви инфекции, тя може да бъде идентифицирана. Некодиращата РНК може да бъде разделена с помощта на транскриптомни технологии. И също така може да се следи експресията на гени при различни екологични натоварвания.

Какви са приликите между протеомиката и транскриптомиката?

  • И двете формират част от концепцията за omic технологията. И двете се използват при диагностика на заболяването и характеристика на заболяването на организъм. И двете области на изследване включваха извличане на биомолекулата, разделяне на биомолекулата и етапи на секвениране.

Каква е разликата между протеомиката и транскриптомиката?

Protemics vs Transcriptomics
Протеомиката включва цялостно изследване на всички протеини в жив организъм.Транскриптомиката е пълното изследване на всички пратеници на РНК (мРНК) молекули, присъстващи в жив организъм.
Проучван биомолекулен тип
Протеините се изучават в протеомиката.тРНК се изследват в транскриптомиката.
Изследвани фактори
Структурата, функцията, взаимодействията, модификациите и приложението на протеините се изучават в протеомиката.Структурата на последователността, взаимодействията със средата и приложенията на тРНК се изучават в транскриптомиката.

Обобщение - Протеомика срещу транскриптомика

Омиците играят важна роля в областта на науките за живота. Протеомиката се отнася до изследването на протеома, който формира пълните колекции от протеини в клетка или организъм. Транскриптомиката се отнася до изследването на транскриптома, който е пълният набор от експресирана ДНК, който е под формата на тРНК. Двете области на изследване - протеомиката и транскриптомиката, са получени след въвеждането на геномиката и понастоящем се използват широко в медицинската диагностика и при характеризиране и скрининг на организмите. Това е разликата между протеомика и транскриптомика.

Изтеглете PDF от Proteomics vs Transcriptomics

Можете да изтеглите PDF версията на тази статия и да я използвате за офлайн цели, съгласно цитираната бележка. Моля, изтеглете PDF версията тук: Разлика между Proteomics и Transcriptomics

справка:

1.Хорган, Ричард Р и Луиз C Кени. „Omic“ технологии: геномика, транскриптомия, протеомика и метаболомия. “Акушер-гинеколог, Blackwell Publishing Inc, 18 юли 2011 г. Достъпно тук
2. Грейвс, Пол Р. и Тимоти А. Дж. Хейстеад. „Ръководство за протеомика на молекулярния биолог.“ Отзиви за микробиология и молекулярна биология, Американско дружество за микробиология, март 2002 г. Достъпно тук
3.Lowe, Rohan и др. “Технологии на транскриптомика.” PLoS Computational Biology, Public Library of Science, May 2017. Достъпно тук

С любезност на изображенията:

1.´Proteomics´By Xxl7441 в английски Wikibooks - Прехвърлен от en.wikibooks в Commons., (Public Domain) чрез Commons Wikimedia
2.’Microarray и секвениране на поточна клетка от Thomas Shafee - Собствена работа (CC BY 4.0) чрез Commons Wikimedia